山楂丸是治疗消化不良最常用的非处方药。山楂丸中的成分之一山楂含有三萜皂甙类（熊果酸、齐敦果酸、山楂酸等）、鞣质、维生素ｃ、脂肪酸等酸性物质。正是这些有机酸和许多药物发生了配伍方面的变化，以下三类药就不能与山楂丸同服。
1、抗生素
山楂丸与大环内酯类药物同服，会使红霉素处于较强的酸性环境中，破坏红霉素的化学结构（红霉素的单键水解），使其抗菌效力减低，甚至失效。山楂丸与磺胺类药物合用，可使尿液酸化，使磺胺乙酰溶解度降低，在肾小管中析出结晶，引起结晶尿、血尿、肾功能衰竭。山楂丸与庆大霉素、妥布霉素、链霉素、卡那霉素、新霉素、巴龙霉素等氨基糖甙类药物配伍应用，治疗泌尿系感染时，使这些药物在酸性环境中的吸收减少，抗菌活性降低，影响疗效。
2、碱性药物
山楂丸与碱性药物如碳酸氢钠、胃舒平、碳酸钙、钙铋镁散、氨茶碱等同服，可产生酸碱中和反应，使这些药物药效减弱或丧失。山楂中含有糖甙，能和含金属离子的药物形成螯合物，相互影响吸收，从而降低药物疗效。山楂有促进消化液分泌的作用，使胃酸增多，故正在服用治疗胃及十二指肠溃疡药物的患者应禁用。山楂丸与小檗碱、咖啡因、东莨碱、喜树碱、利血平等合用时，能使肾小管对这些药物的重吸收减少，排泄增多，从而降低药效。
3、某些酸性药物
山楂丸与有些酸性药物合用，可增加这些药物在肾脏中的重吸收，给肾脏带来毒性。这些药物有阿司匹林、吲哚美辛等。
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