中医讲“药食同源”，又说“药补不如食补”，木瓜就是一种既有食疗作用又有药用价值的水果。木瓜的营养成份很多，其中之一就是木瓜富含维生素c，其含量是苹果的48倍，半个中等大小的木瓜足供成人整天所需的维生素c。同时，木瓜富含17种以上氨基酸及钙、铁、蛋白酶等。木瓜香甜可食，炒、煮、腌或制成蜜饯均是美味佳肴。因木瓜乳液中含有一种“木瓜酵素”，可以分解肉类蛋白质，因此饭后食用可以助消化，有治疗肠胃炎、消化不良等疾病的作用;烹调时可以将肉类的结缔组织分解，用木瓜炖肉，肉质也会更鲜嫩。
木瓜味酸，微寒，入肝、脾经。《海药本草》：“敛肺和胃，理脾伐肝，化食止渴。”这里就介绍一种具有健脾消食的木瓜沙拉——
1·木瓜一剖两半，挖去瓜肉，作盛物容器。2·芒果、木瓜、菠萝、香蕉、奇异果切片备用。3·以上水果放入木瓜碗中，滴入莱姆汁，适量加糖，拌上沙拉即成。
一般人均可食用，尤其是消化不良更佳，但煮熟的木瓜没有这个效果，因为高热破坏了酵素的活性。由于木瓜性偏寒，因此胃寒、体虚者不宜多吃。木瓜中的番木瓜碱对人体有小毒，每次食量不宜过多，过敏体质者应慎食。而且，古代医家在医书中提到：“忌铅、铁。”
生吃的木瓜多是产于南方的番木瓜，而北方木瓜（宣木瓜）不宜鲜食，多作药材治病用。作为水果吃的新鲜木瓜，最好选瓜身细长，瓜肉厚、瓜籽少、汁水多者，而瓜身圆，形似葫芦或沙田柚者，肉薄籽多、瓜汁稍少的则适合做成菜肴。有益消化的酶在未成熟的青木瓜中含量最高，大约是成熟后红木瓜的2倍，因此买木瓜时最好选择青木瓜，而生吃则以半生熟的为佳。
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