因为酸牛奶中存在的乳酸菌系活的细菌，如果经过加热或用开水冲饮，活的乳酸菌就会被杀死，使酸牛奶失去其特有的保健作用。
另外，酸奶不宜空腹饮用空腹时，胃酸浓度高，ph值在2以下，活的乳酸菌在胃液中极易被杀灭。一般在饭后2小时饮用较合适。饮用酸牛奶后应漱口。酸牛奶中含有大量乳酸菌，能将牙体组织中的有机质毁坏，逐渐产生龋洞。饮用酸牛奶后即刻用温开水、茶水或漱口液漱口，对预防龋齿有着重要的作用。
目前，市场上有很多配制型乳酸饮料品种，多以“乳酸奶”字样出售，其实是由牛奶或奶粉、糖、乳酸或柠檬酸、苹果酸、香料、稳定剂等加工配制成的，并不具有酸牛奶的保健作用。所以在购买时要细加识别，以免错当酸牛奶饮用。
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